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Science子刊:黏連蛋白在白血病中調(diào)節(jié)選擇性剪接過程中扮演的關(guān)鍵角色
[ 來源:轉(zhuǎn)載自網(wǎng)絡(luò)   發(fā)布日期:2023-03-17 09:52:03  責(zé)任編輯:  瀏覽次 ]


2023年3月1日,一篇發(fā)表在國(guó)際雜志Science Advances上題為“Cohesin regulates alternative splicing”的研究報(bào)告中,來自美國(guó)國(guó)家癌癥研究所等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究發(fā)現(xiàn)了黏連蛋白與已知的剪接因子之間的因果關(guān)聯(lián),以及與獨(dú)特剪接模式的公共數(shù)據(jù)集的相關(guān)性,且黏連蛋白的降解會(huì)導(dǎo)致剪接過程的明顯改善,這并不依賴于對(duì)轉(zhuǎn)錄的影響效應(yīng)。

黏連蛋白(Cohesin)是一種能建立姐妹染色單體凝聚力的三聚體復(fù)合物,其在染色質(zhì)的組織和轉(zhuǎn)錄過程中扮演著關(guān)鍵作用,而黏連蛋白在調(diào)節(jié)選擇性剪接(alternative splicing)過程中所扮演的新角色或許為闡明人類疾病發(fā)生過程中的剪接突變提供了新的線索和思路。

選擇性剪接是發(fā)生在人類機(jī)體蛋白質(zhì)產(chǎn)生過程中的一種常規(guī)活動(dòng),基因組中充滿了制造蛋白質(zhì)的基本功能代碼,但機(jī)體自身依靠的不僅僅是編碼的內(nèi)容來發(fā)揮作用,有一些機(jī)制能增強(qiáng)RNA的功能從而形成能發(fā)揮不同組織特異性功能的多種蛋白質(zhì),這就好像利用基本的松餅配方就能轉(zhuǎn)變成為多種美味的食物一樣,選擇性剪接能增加并重排RNA成分從而形成新的蛋白質(zhì)。

有一些已知因素參與到了選擇性剪接過程中,而黏連蛋白并不在這個(gè)名單上;然而,在一些疾病中黏連蛋白的突變頻率會(huì)高達(dá)20%,比如急性髓性白血病(AML),其經(jīng)常與選擇性剪接模式的重大改變有關(guān),而這種關(guān)聯(lián)性足以讓研究人員仔細(xì)分析研究。為此,研究人員分析了兩大獨(dú)立公開的來自AML患者樣本的RNA測(cè)序數(shù)據(jù),他們分析了已知剪接因子發(fā)生突變的樣本(并沒有黏連蛋白的突變),這或許就是此前預(yù)期的不正確的選擇性剪接的原因。研究人員將其與黏連蛋白未發(fā)生突變或剪接因子(一類野生型的對(duì)照組)未發(fā)生突變的AML患者機(jī)體樣本的剪接模式進(jìn)行比較,第三組則是黏連蛋白發(fā)生突變但剪接因子未發(fā)生突變的樣本的剪接模式,如果黏連蛋白不是一個(gè)因素,這或許就與野生型并無區(qū)別。

分析結(jié)果表明,與黏連蛋白突變相關(guān)的剪接的特殊模式并未在其它數(shù)據(jù)庫中觀察到,而當(dāng)攜帶黏連蛋白突變(但并不是剪接因子突變)的AML樣本與攜帶剪接因子突變的樣本進(jìn)行比較時(shí),剪接模式或許就存在明顯的差異。在一系列實(shí)驗(yàn)中,已知的剪接因子BRD4能被選擇性地納入或排除在含有黏連蛋白的細(xì)胞外,而且研究人員觀察到了黏連蛋白或BRD4單獨(dú)或聯(lián)合調(diào)節(jié)的選擇性剪接的不同模式,這些研究結(jié)果或許就能確定黏連蛋白在調(diào)節(jié)選擇性剪接過程中此前未知的角色,無論是單獨(dú)還是與BRD4一起通過直接與選擇性機(jī)器組分相互聯(lián)系。

為了進(jìn)一步證明黏連蛋白的突變會(huì)直接影響選擇性剪接,研究人員分析了兩類被工程化修飾攜帶單一點(diǎn)突變(通常會(huì)在AML患者中被觀察到)的小鼠胚胎干細(xì)胞系,研究者觀察到了其與剪接因子相互作用的減少以及剪接模式的改變,這就證明了其之間的因果關(guān)聯(lián)。此外,研究人員還識(shí)別出了在正常和白血病細(xì)胞中黏連蛋白在調(diào)節(jié)選擇性剪接過程中的關(guān)鍵角色,這就為闡明黏連蛋白突變?cè)谌祟惣膊≈械淖饔锰峁┝诵碌囊娊。與其它任何好的研究一樣,目前研究人員還需要進(jìn)行更為深入的研究來調(diào)查黏連蛋白的突變對(duì)其它癌癥和疾病的影響效應(yīng),在這些疾病中研究人員此前并未闡明黏連蛋白的作用。

綜上,本文研究識(shí)別出了黏連蛋白在正常和白血病細(xì)胞中調(diào)節(jié)選擇性剪接的關(guān)鍵角色,或?yàn)殛U明黏連蛋白的突變?cè)谌祟惣膊“l(fā)生過程中的作用提供了新的線索和思路。

鄭重聲明:本文版權(quán)歸原作者所有,轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的,如作者信息標(biāo)記有誤,請(qǐng)第一時(shí)間聯(lián)系我們修改或刪除。



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