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近日，一篇發(fā)表在預印版平臺bioRxiv上題為“Predictions for the binding domain and potential new drug targets of 2019-nCoV”的研究報告中，來自北京科技大學的研究人員通過研究成功預測了新型冠狀病毒（2019-nCoV）的結(jié)合域和新型潛在的藥物靶點。

然而，當前使用Swiss模型的研究還需要進一步優(yōu)化，比如，預測S蛋白結(jié)構(gòu)上配體結(jié)合位點尚不明確，此外，模板僅共享了76.4%的序列一致性，這就意味著結(jié)果可能無法完全反映現(xiàn)實，因此，研究人員就需要開發(fā)出一種新方法，從另一個角度來預測蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)和相關功能，最重要是，這種新方法還能幫助預測潛在的藥物靶點。

這項研究中，研究人員開發(fā)出了一種名為I-TASSER（迭代線程組裝改進，Iterative Threading Assembly Refinement）的新方法來進行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的預測；當研究者將I-TASSER模型與實際SARS模型進行比較后他們發(fā)現(xiàn)，2019-nCoV的表面糖蛋白與S蛋白的CTD1（C末端結(jié)構(gòu)域1）區(qū)域相一致，這就表明，2019-nCoV可能是通過構(gòu)象改變來與宿主細胞的ACE2相結(jié)合的。此外，研究者還對2019-nCoV表面糖蛋白的位點進行預測后發(fā)現(xiàn)，某些核心的氨基酸或有望成為開發(fā)抵御2019-nCoV潛在新型藥物靶點。

除此之外，研究人員還開發(fā)了一種名為Phyre2的工具，其能利用遠程同源檢測的手段來構(gòu)建3D模型，并預測配體結(jié)合位點，從而分析氨基酸突變所產(chǎn)生的影響，Phyre2與其它方法的區(qū)別不在于準確性而在于實用性；最后研究者表示，I-TASSER和Phyre2兩種工具均能用來幫助預測武漢新冠肺炎病毒的刺突蛋白的精確結(jié)構(gòu)，從而為尋找新型藥物靶點提供了新的線索和思路。